Table 1 Overview of relative peak heights (RPH) of 28 HA-glycan peaks during virus adaptation from MDCK to Vero cells, and of two harvest time points in a cultivation with MDCK cells. For virus adaptation, MDCK cell-derived virus seed was consecutively passaged in Vero cells (pass. 1 to pass. 5). Two harvest time points, 24 and 72 hours post infection (hpi), compared by absolute values of RPH and percentage difference |ΔRPH|. Maximal SD and maximal |ΔRPH| are highlighted in bold.
From: Impact of different influenza cultivation conditions on HA N-Glycosylation
Peak | Virus Adaptation | Time Course | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|  | seed | pass. 1 | pass. 2 | pass. 3 | pass. 4 | pass. 5 | pass. 1 to 5 | 24 hpi | 72 hpi | |ΔRPH| |
No. | Relative Peak Height (RPH) [%] | SDRPH* [%] | RPH [%] | [%] | ||||||
1 | 7,8 | 0,9 | 1,7 | 0,9 | 2,2 | 4,8 | 1,6 | 3,9 | 4,5 | 0,6 |
2 | 3,9 | 5,7 | 4,6 | 5,1 | 6,1 | 4,3 | 0,7 | 2,4 | 2,8 | 0,4 |
3 | 0,0 | 2,2 | 1,9 | 3,4 | 1,4 | 1,4 | 0,8 | 0 | 0 | 0 |
4 | 8,1 | 6,6 | 5,9 | 6,1 | 6,8 | 6,8 | 0,4 | 5,3 | 5,2 | 0,1 |
5 | 0,0 | 4,0 | 2,7 | 2,5 | 2,5 | 1,9 | 0,8 | 0 | 0 | 0 |
6 | 1,4 | 2,5 | 1,9 | 1,5 | 1,5 | 1,7 | 0,4 | 2,1 | 1,7 | 0,4 |
7 | 6,2 | 4,4 | 4,8 | 4,1 | 4,7 | 4,8 | 0,3 | 4,0 | 3,6 | 0,4 |
8 | 6,5 | 10,0 | 9,6 | 8,1 | 7,4 | 7,6 | 1,2 | 5,3 | 5,2 | 0,1 |
9 | 1,7 | 4,3 | 3,4 | 3,4 | 4,1 | 5,6 | 0,9 | 1,1 | 1,1 | 0 |
10 | 13,7 | 25,8 | 23,5 | 27,2 | 28,6 | 24,3 | 2,1 | 17,6 | 16,3 | 1,3 |
11 | 6,8 | 11,8 | 12,3 | 12,2 | 11,7 | 9,5 | 1,2 | 5,5 | 4,9 | 0,6 |
12 | 6,2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2,5 | 2,5 | 0 |
13 | 2,0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 4,6 | 4,4 | 0,2 |
14 | 3,1 | 0,6 | 1,1 | 1,9 | 1,3 | 1,5 | 0,5 | 3,7 | 3,6 | 0,1 |
15 | 6,3 | 4,1 | 4,1 | 4,4 | 3,8 | 3,5 | 0,3 | 5,0 | 4,7 | 0,3 |
16 | 2,2 | 7,7 | 7,4 | 7,4 | 7,8 | 8,9 | 0,6 | 5,9 | 6,0 | 0,1 |
17 | 1,6 | 3,3 | 4,4 | 3,3 | 3,1 | 4,3 | 0,6 | 2,3 | 2,8 | 0,5 |
18 | 1,3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1,9 | 2,3 | 0,4 |
19 | 4,5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3,6 | 4,1 | 0,5 |
20 | 2,0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 8,0 | 7,0 | 1,0 |
21 | 2,6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1,7 | 2,2 | 0,5 |
22 | 3,3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3,9 | 3,8 | 0,1 |
23 | 0,0 | 4,7 | 7,9 | 6,2 | 5,0 | 6,4 | 1,3 | 0 | 1,7 | 1,7 |
24 | 1,9 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1,6 | 1,7 | 0,1 |
25 | 0,0 | 1,5 | 3,0 | 2,3 | 1,9 | 2,6 | 0,6 | 0 | 0 | 0 |
26 | 2,4 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2,2 | 2,1 | 0,1 |
27 | 1,1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 2,3 | 2,3 | 0 |
28 | 3,1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 3,7 | 3,4 | 0,3 |