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Table 2 Significance of individual markers with all animals genotyped, corrected for polygenic effects.

From: Efficient detection of QTL with large effects in a simulated pig-type pedigree using selective genotyping

SNP

F-statistic

σ 2e

σ2a

SNP

F-statistic

σ 2e

σ2a

232

3.59

3.13

1.34

2277

1.64

3.11

1.38

274

2.21

3.13

1.34

2692

2.57

3.12

1.36

285

3.93

3.11

1.37

2733

1.14

3.13

1.36

289

4.40

3.14

1.32

3007

0.96

3.13

1.36

290

2.83

3.11

1.38

3008

1.52

3.13

1.35

296

4.72

3.12

1.36

3011

0.85

3.13

1.36

302

2.95

3.10

1.39

3014

2.86

3.12

1.36

361

2.14

3.13

1.35

3024

6.30

3.12

1.35

386

2.39

3.12

1.35

3029

3.25

3.12

1.36

396

4.65

3.11

1.37

3030

22.97

3.10

1.31

397

10.33

3.13

1.31

3031

9.57

3.10

1.37

399

3.52

3.11

1.37

3032

15.25

3.10

1.34

403

3.79

3.11

1.38

3033

42.24

3.10

1.22

404

11.66

3.14

1.29

3034

0.49

3.12

1.38

411

2.56

3.11

1.38

3039

4.36

3.12

1.35

415

16.50

3.12

1.31

3040

4.60

3.12

1.35

416

8.79

3.13

1.31

3043

3.82

3.12

1.35

426

2.24

3.14

1.33

3045

16.26

3.12

1.29

428

0.94

3.13

1.35

3046

0.76

3.13

1.36

437

2.97

3.13

1.35

3047

23.68

3.09

1.32

439

3.56

3.13

1.35

3048

38.52

3.09

1.27

442

3.07

3.13

1.35

3049

10.23

3.11

1.35

444

4.61

3.11

1.37

3051

7.44

3.10

1.37

450

1.27

3.13

1.35

3056

7.92

3.11

1.35

452

2.73

3.12

1.37

3058

18.18

3.10

1.33

455

1.06

3.13

1.35

3061

7.42

3.10

1.37

457

0.62

3.13

1.36

3062

19.81

3.08

1.36

464

2.15

3.13

1.34

3068

11.19

3.10

1.36

466

6.12

3.14

1.31

3079

17.56

3.08

1.37

513

6.08

3.13

1.32

3080

6.71

3.11

1.36

534

5.01

3.13

1.34

3082

6.10

3.10

1.38

726

0.98

3.13

1.36

3091

5.96

3.10

1.38

1125

0.73

3.13

1.35

3151

3.74

3.13

1.34

1212

4.85

3.12

1.34

3159

3.75

3.12

1.35

1326

8.79

3.13

1.32

3177

0.40

3.12

1.36

1483

23.68

3.10

1.31

3180

0.45

3.12

1.37

1498

14.27

3.11

1.32

3182

3.81

3.12

1.35

2160

2.24

3.12

1.36

3192

0.77

3.13

1.36

2162

2.55

3.12

1.36

3229

2.80

3.11

1.37

2166

2.42

3.12

1.36

3479

4.62

3.13

1.33

2173

0.60

3.12

1.36

3487

0.97

3.12

1.37

2176

0.67

3.12

1.37

3506

2.20

3.13

1.35

2178

2.40

3.13

1.34

3514

1.58

3.13

1.36

2180

2.06

3.12

1.37

3546

4.37

3.12

1.35

2182

2.08

3.12

1.37

3550

4.68

3.12

1.35

2183

2.90

3.12

1.36

3558

0.77

3.13

1.35

2185

5.09

3.13

1.34

3646

3.04

3.12

1.35

2187

2.93

3.12

1.35

3701

5.87

3.14

1.32

2189

4.55

3.12

1.35

3710

13.93

3.15

1.27

2190

0.76

3.12

1.36

3714

11.53

3.15

1.27

2192

3.71

3.12

1.36

3716

11.03

3.12

1.32

2193

0.49

3.12

1.37

3765

37.63

3.16

1.15

2196

2.72

3.12

1.35

3766

32.27

3.14

1.19

2219

0.84

3.12

1.37

3965

7.95

3.14

1.30

2220

2.77

3.11

1.37

4891

0.97

3.12

1.37

2221

2.45

3.11

1.38

5156

0.40

3.12

1.37

2225

5.75

3.10

1.37

5330

1.14

3.13

1.35