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Table 2 Significance of individual markers with all animals genotyped, corrected for polygenic effects.

From: Efficient detection of QTL with large effects in a simulated pig-type pedigree using selective genotyping

SNP F-statistic σ 2e σ2a SNP F-statistic σ 2e σ2a
232 3.59 3.13 1.34 2277 1.64 3.11 1.38
274 2.21 3.13 1.34 2692 2.57 3.12 1.36
285 3.93 3.11 1.37 2733 1.14 3.13 1.36
289 4.40 3.14 1.32 3007 0.96 3.13 1.36
290 2.83 3.11 1.38 3008 1.52 3.13 1.35
296 4.72 3.12 1.36 3011 0.85 3.13 1.36
302 2.95 3.10 1.39 3014 2.86 3.12 1.36
361 2.14 3.13 1.35 3024 6.30 3.12 1.35
386 2.39 3.12 1.35 3029 3.25 3.12 1.36
396 4.65 3.11 1.37 3030 22.97 3.10 1.31
397 10.33 3.13 1.31 3031 9.57 3.10 1.37
399 3.52 3.11 1.37 3032 15.25 3.10 1.34
403 3.79 3.11 1.38 3033 42.24 3.10 1.22
404 11.66 3.14 1.29 3034 0.49 3.12 1.38
411 2.56 3.11 1.38 3039 4.36 3.12 1.35
415 16.50 3.12 1.31 3040 4.60 3.12 1.35
416 8.79 3.13 1.31 3043 3.82 3.12 1.35
426 2.24 3.14 1.33 3045 16.26 3.12 1.29
428 0.94 3.13 1.35 3046 0.76 3.13 1.36
437 2.97 3.13 1.35 3047 23.68 3.09 1.32
439 3.56 3.13 1.35 3048 38.52 3.09 1.27
442 3.07 3.13 1.35 3049 10.23 3.11 1.35
444 4.61 3.11 1.37 3051 7.44 3.10 1.37
450 1.27 3.13 1.35 3056 7.92 3.11 1.35
452 2.73 3.12 1.37 3058 18.18 3.10 1.33
455 1.06 3.13 1.35 3061 7.42 3.10 1.37
457 0.62 3.13 1.36 3062 19.81 3.08 1.36
464 2.15 3.13 1.34 3068 11.19 3.10 1.36
466 6.12 3.14 1.31 3079 17.56 3.08 1.37
513 6.08 3.13 1.32 3080 6.71 3.11 1.36
534 5.01 3.13 1.34 3082 6.10 3.10 1.38
726 0.98 3.13 1.36 3091 5.96 3.10 1.38
1125 0.73 3.13 1.35 3151 3.74 3.13 1.34
1212 4.85 3.12 1.34 3159 3.75 3.12 1.35
1326 8.79 3.13 1.32 3177 0.40 3.12 1.36
1483 23.68 3.10 1.31 3180 0.45 3.12 1.37
1498 14.27 3.11 1.32 3182 3.81 3.12 1.35
2160 2.24 3.12 1.36 3192 0.77 3.13 1.36
2162 2.55 3.12 1.36 3229 2.80 3.11 1.37
2166 2.42 3.12 1.36 3479 4.62 3.13 1.33
2173 0.60 3.12 1.36 3487 0.97 3.12 1.37
2176 0.67 3.12 1.37 3506 2.20 3.13 1.35
2178 2.40 3.13 1.34 3514 1.58 3.13 1.36
2180 2.06 3.12 1.37 3546 4.37 3.12 1.35
2182 2.08 3.12 1.37 3550 4.68 3.12 1.35
2183 2.90 3.12 1.36 3558 0.77 3.13 1.35
2185 5.09 3.13 1.34 3646 3.04 3.12 1.35
2187 2.93 3.12 1.35 3701 5.87 3.14 1.32
2189 4.55 3.12 1.35 3710 13.93 3.15 1.27
2190 0.76 3.12 1.36 3714 11.53 3.15 1.27
2192 3.71 3.12 1.36 3716 11.03 3.12 1.32
2193 0.49 3.12 1.37 3765 37.63 3.16 1.15
2196 2.72 3.12 1.35 3766 32.27 3.14 1.19
2219 0.84 3.12 1.37 3965 7.95 3.14 1.30
2220 2.77 3.11 1.37 4891 0.97 3.12 1.37
2221 2.45 3.11 1.38 5156 0.40 3.12 1.37
2225 5.75 3.10 1.37 5330 1.14 3.13 1.35